Restart останвливает службу и заново запускает. Reload даёт команду службе перечитать файлы конфигурации без остановки работы.
Shell - это один из командных интерпретаторов, поставляемых вместе с ОС unix. Программа на языке Shell называется скриптом. Shell скрпитам указывают расширение *.sh и работают они в Unix системах. Если вам надо запустить shell скрипт в windows, то можно установить подсистему Linux Ubuntu или установить отдельно интерпретатор Shell для windows.
Пример установки сертификата Let's Encrypt для nginx и ubuntu 16.04 с использованием certbot клиента.
Алгоритм настройки Chrome для запуска из меню приложений с флагами
Команда sed - это потоковый редактор текста. Вставляет/изменяет/добавляет текст не открывая файл визуально. Обычно используется в скриптах.
Определение wildcard SSL. Краткий список шагов ручного получения бесплатного wildcard SSL-сертификат от Lets Encrypt на примере CentOS 7 и утилиты acme.sh